Amikor az Enterprise legénységét hazahívják kiderül, hogy egy a szervezeten belülről jövő megállíthatatlan erő felrobbantotta a flottát és mindent, amit a flotta képviselt és ezzel a világunkat válságba sodorta. Kirk kapitánynak személyes elszámolni valója is van, elindítja az embervadászatot a háborús zónába, hogy elkapja az embert aki maga egy tömegpusztító fegyver. Miközben hőseinket beszippantja az élet és halál világméretű sakkjátszmája, szerelmek kerülnek veszélybe, barátságok szakadnak szét és áldozatokat kell hozni az egyetlen családért, ami Kirk-nek maradt, azaz a legénységért.