Az Impossible Mission Force-t feloszlatták, Ethan így magára hagyott ügynök lett és a csapat ebben a helyzetben kerül szembe egy magasan képzett különleges ügynökökből álló hálózattal, a Szindikátussal. A rendkívül rátermett alakulat minden áron új világrendet akar létrehozni és ezt terrortámadások egyre durvuló sorozatával szándékozik véghez vinni. Ethan összegyűjti csapatát és hozzájuk szegődik a szakadár brit ügynök, Ilsa Faust is aki talán a tagja ennek az "Titkos nemzetnek". Így néznek szembe az eddigi leglehetetlenebb küldetésükkel.