Tom, Jerry, Johhny Quest és társa, Hadji egy veszélyes küldetésre vállalkoznak, hogy megmentsék a világot. Az egész egy átlagos napnak indul melyen Tom a strandon kergeti az egeret, de miután találkoznak Johhny-val, az események hirtelen fordulatot vesznek. A Quest család ősi ellensége, Dr. Zin felfedezi, hogy a fiatal kém apja - Dr. Benton - megalkot egy eszközt mely végérvényesen megoldaná a világ energiaproblémáit. Zind elküldi gonosz macska seregét, hogy lopják el a találmányt és fogják el Benton doktort és testőrét, Race Bannon-t. Johhny és új barátai akcióba lendülnek, hogy megakadályozzák az ördögi tervet.